下御霊神社の創建は、863（貞観5）年 。陰謀によって自害に追い込まれた桓武天皇の皇子・伊予親王とその母・藤原吉子らの霊を慰めるためにつくられた。つまり平安遷都直後の政争の犠牲者をお祀りしているのである。祭神は、後に、崇道天皇、吉備真備、藤原広嗣、橘逸勢、文屋宮田麿、火雷天神を加えて八所御霊となる。